奇恒之府名出《素问·五脏别论》：“脑、髓、骨、脉、胆、女子胞，此六者，地气之所生也，皆藏于阴而象于地，故藏而不泻，名曰奇恒之府。”脏、腑、奇恒之府，为人体三类不同的器官，有其各自的形态和功能特点。脑、髓、骨、脉、胆、女子胞等脏器，虽然在形态上均具有“管腔中空”的特点而与腑相似，但其功能却是“藏精”而近似于脏，所以“藏于阴而象于地，故藏而不泻”。这正是其与胃、胆、小肠、大肠、膀胱、三焦等一般传化之腑的“其气象天，故泻而不藏”相区别之处，也正是其总称奇恒之府的原因。
朱氏认为历代医家对奇恒之府的生理、病理讨论甚少，往往只将其附于五脏之中略加介绍，具体的奇恒之府至今在概念上仍含糊不清。
奇恒之府的“脑”，应该是指颅腔。但书中却往往将其与实质性的脑混为一谈。如曰：“脑为奇恒之府之一，位于颅内，由髓汇集而成。”照此理解，则成了“颅内”藏有一个由髓汇集而成、形态中空似腑、属于奇恒之府的“脑”，显然不妥。因此，应作这样的区分：奇恒之府的“脑”，本指颅腔。颅腔内藏有主精神活动、主感觉和运动等功能的脑。脑属于一个实质性器官，即“君主之官”、“元神之府”、“神明之心”之谓。颅腔内还汇集有髓汁，即“脑（颅腔）为髓之海”，颅腔内的髓汁，称为“脑髓”，具有濡养实质性的脑的作用。这样，颅腔、脑、脑髓的形质、功能各异，三者方不致混淆，也才符合奇恒之府中空似腑、藏精似脏的规定。
奇恒之府的“髓”，实际是指脊椎管。《素问·解精微论》所说“髓者，骨之充也”，《素问·五脏生成》所说“诸髓者，皆属于脑”，则是指汇藏于骨、脊椎管、颅腔内的髓汁。但是，这两个“髓”以往在概念上常造成误解。如《简明中医辞典》说：“髓，奇恒之府之一。即骨髓和脊髓。髓由肾的精气与水谷精微所化生，有充养骨骼，补益脑髓的作用。”若照文理解，奇恒之府的“髓”这一器官，不仅可分为骨髓和脊髓两个部分，并且具有充养另外一个奇恒之府（骨骼）的作用。这就是将管腔中空的奇恒之府——髓——脊椎管与精微物质的髓汁混为一谈了。
女子胞为子宫，内可藏经血、育胎儿，与生殖有关，故属奇恒之府。男子虽无女子胞，但有精室，藏精而关系生殖。《难经·三十九难》说：“命门者，精神之所舍也，男子以藏精，女子以系胞。”唐容川《医经精义》更说：“女子之胞，名血海、名子宫，以其行经孕子也。男子之胞，名丹田、名气海、名精室，以其为呼吸之根，藏精之所也。”故男子精室可视为奇恒之府。
