中医临床各科的辨证，都与《金匮》以“五脏论杂病”有关，邹氏有鉴于此，故将五脏辨证理论运用于内、妇、儿、眼、喉、疮疡、皮肤、骨伤各科临床中，不仅在理论上达到了规范化，而且在诊治疾病时方便实用。现在就分科简介如下：
1．在内科方面分五脏之病、证
肺的疾病有感冒、咳嗽、哮喘、肺痨、肺痈等。症状有鼻塞、喉干、咳喘、痰鸣、胸痛少气、忧悲、肌肤甲错、毛发焦枯等。
心的疾病有心痛、心悸、失眠、癫狂、血证等。症状有神昏、谵妄、烦躁、多梦、惊悸、怔忡、发狂、面赤，舌红、绛、青紫，汗液变化等。
脾的疾病有痰饮、积聚、泄痢、水肿、臌胀、痹证、痿证、脘腹痛等。症状有四肢酸软、食少便溏、便下脓血、便秘腹胀、消谷善饥、口唇诸病等。
肝的疾病有眩晕、中风、厥证、痉病、破伤风、痫证、郁证、疝气等。症状有头目之候、四肢抽搐、角弓反张、屈伸不利、颤抖麻木、口眼歪斜、半身不遂、少腹、阴部之候等。
肾的疾病有消渴、淋证、遗精、阳痿、遗尿、癃闭等。症状有腰痛酸软、耳鸣、齿齘、小便不利诸证、尿浊、精冷、骨节疼痛等。
2．在妇科方面，无论胎、产、经、带，皆以肝为主，本叶天士“肝为女子先天”之论。因肝为藏血之脏，其气疏泄，妇女以血为本，情志又多抑郁。冲为血海，任主胞胎，二脉又与肝经密切相关。如果肝不藏血则任脉虚，血海枯，可导致经乱、经闭；肝失疏泄，情志抑郁，也必引起多种妇科疾病。肝经失调，还可导致五脏病变。
3．在儿科方面，北宋钱乙奠定了以五脏为纲的证治基础，提出了五脏虚实及常用治法。
肝实则目直视，大叫、呵欠、项急、烦闷；肝虚则咬牙，多欠气。肝病有泻青丸之方。
心实则多哭，发热饮水而搐；心虚则困卧，悸动不安。心病有泻心导赤散。
脾实则困睡，身热饮水；脾虚则吐泻生风。脾病有益黄散。
肺实则闷乱，喘促而渴饮；肺虚则哽气，长出气。肺病有泻白散。
肾有虚无实。肾病有六味地黄丸。
4．在眼科方面，本“五轮”、“五脏”以辨证论治。引《审视瑶函》之说：“目有五轮，属乎五脏，眼通五脏，气贯五轮。轮属标，脏属本，轮之有病，莫不由脏气不平所致。”邹氏重视“察轮识病”：风轮变色，肝经受邪；血轮胬肉，心经余热；胞睑肿胀，脾经湿热；气轮红赤，肺经有火；视瞻昏渺，肾经郁热。
5．在喉科方面，也强调五脏证治。咽连胃管，其气通于脾，故多脾湿胃火之证，如口疮、牙痛等病。喉连气道，其气通于肺，喉病多肺热津伤之证。肝失调达，气郁化火，痰气郁结，则成梅核气、廉珠喉痹之证。心火上炎，则口舌生疮。肾阴不足，多致失音、虚火喉痹之证。
6．在疮疡方面，更从五脏证治理论上，提出疮毒化火，入于血脉，外发皮肉之分而形成阳证疮疡，内陷筋骨之分而形成阴证疮疡。若为逆证，邪气盛则疮毒内攻脏腑，则形成“走黄”之证，正气虚而疮毒内陷脏腑，则形成“三陷证”。
7．在皮肤病方面，也强调五脏辨证，指出发病部位虽在皮肤，但无不影响五脏。本病多湿则关系到脾，化火痒甚则关系到心，多风多虫则关系到肝，反复发作，长期不愈，成为虚寒之证则关系到肾。
8．在骨伤方面，则从皮、脉、肉、筋、骨五体之伤，而内损及肺、心、脾、肝、肾，不仅为骨骼之伤。凡伤皮而致肺虚者，则见面色淡白，唇爪无华，舌质淡，脉虚大；伤肉而及脾者，则见面黄肌瘦，舌胖苔腻，脉濡而缓；伤血脉而及心者，则见瘀血凝滞诸证；伤筋而及肝者，则见面色青，脉弦紧；伤骨而及肾者，则见面色黧黑，腰痛神倦，二便失常，脉沉而细等证。
