易学家多把《内经》作为易学最主要的参考资料；中医学也将《易经》作为中医理论的渊薮。
这两部书皆成书于周代，理论依据一致，都建立在古天文学、古气象学的基础之上，所以这两部书在学术上长期互相渗透，相得益彰。邹氏医易会通的学术思想就是在这个基础上建立起来的。他认为《内经》所讲的五运六气，就是本《易经》而来，就是一部古天文学、古气象学。“运”，是指天体运行，但观测分为东南西北中五方观察，故称“五运”，这就是一部古天文学的内容。
“气”，指应天体运行而产生的气象变化，有风寒暑湿燥火六种状态，故称“六气”，这就是一部古气象学。至于天人合一、阴阳五行、脏腑经络、诊断、治则、方药，莫不依据易理而来。《灵枢·针解篇》：“一天、二地、三人、四时、五音、六律、七星、八风、九野，身形亦应之。”这就是把大自然的天象变化与人体气化活动结合起来看问题，这也就是邹氏主张医易会通以防病治病的理论依据和指导思想。《易经》和《内经》虽然历史久远，但她确实是中国古代文明史和医学史上的两颗明珠，有鉴于此，他用了浪漫主义和现实主义相结合的笔调写了一段话，来说明这个问题：“易经和内经是两部极古老的著作，她确实是中国古代文明史和医学史上的两颗明珠，她的神奇光焰惊动了远隔重洋的邻居，许多异国英雄曾经废寝忘食地追求过她。她却很难接近，即使走到她跟前，仍隔着一层香雾，只依稀地看到她的面纱，只有少数虔诚者能偶尔一睹芳颜。但灯台照人不照己，在这两颗光芒四射的明珠下面的人，常常看不到她的任何光亮。相当长的时期以来，中国研究科学技术的人，只看到蜂蝶纷纷过墙去，却疑春色在邻家，完全没有觉察到无边春色不在邻家，而在自己的家园里。有些人不了解她，还斥之为封建唯心之学，说这是提倡天人通以阻碍科学化，她只好忍辱含羞，说声再见！人家还要骂无可奈何花落去，她只好默默地说：花落春常在，有朝一日会似曾相识燕归来的。所以我们知道了这两部书的历史命运，应抱着悲金悼玉的心情来研究它，使它在科学技术界的学者专家的记忆中，留下一个深刻的印象！”邹氏对《易经》和《内经》两书的内容，作了概括的论述，他说：“《易经》文章如神龙出没，见首不见尾，多假借符号、图象或者寓言性的词句以示之，究其实际，皆暗有所指，而意在言外。
《马氏文通》说：春秋之世，文运以神；周秦以后，文运以气；隋唐以后，文运以理。故《易经·系辞》其神化，《礼记·檀弓》其神疏，《左传》其神隽，《论语》其神淡，庄周其神逸。所谓文运以神，是指整个文章，一气呵成，不仅各篇章互为呼应，互为解释，而且一字一句，皆统照全局。在成书年代上，《内经》虽比《易经》稍晚一点，但《内经》却在文法上熔神、气于一炉。如《内经》的《天元纪》、《五运行》、《六微旨》、《气交变》、《五常政》、《六元正纪》、《至真要》、《阴阳应象》、《四气调神》九个大论，分之为九，合之则一，它的结构好像一株树木：《天元纪》为九大论之总纲，如树之有根；《五运行》讲月运，重仰观法；《六微旨》讲日运，重俯察法，言气机在方位上之活动，如树之两大分枝；《气交变》言五星之动变，述气机在上中下之交互变化，有如树木之有干；《五常政》讲标准，《六元正纪》言始点，前者从五运看六气，后者以六气正五运，但均论述天象变化与气化活动的关系，有如树木枝干上之小枝叶；《至真要》属结论，重点在方法上的具体运用，有如树木花果，可以供人食用；《阴阳应象》和《四气调神》则又是七大论内容之杂糅，并有新意，有如树木附生的枝叶。九大论篇章很长，合之却是一个整体，乃专述气化原理，医学大法，其余篇章则分别讲述人体功能和疾病的具体变化。由此可见，《内经》行文，有限制亦若无限制，灵动异常，而且内容博大精深，涉及的学问极广。”（见《易学十讲》台湾繁体字版）
