朱氏对本草研究有素，熟悉药物的性能，处方用药常自出新意，别具一格。
一、引申发展，扩大应用
朱氏认为，人类对事物的认识是永远没有穷尽的。前辈医家由于时代条件的限制，对许多药物的功用，不可能阐发无余，尚有不少潜在功效，等待我们后人去发掘。他根据古籍文献之线索，恒藉现代医学理论，大胆地加以引申发展，扩大应用范围。
如仙鹤草一药为止血要药，常用于咯血、吐血、衄血、便血及妇产科崩漏、月经过多等出血疾患。但此药止中有行，兼擅活血之长，则鲜为人知。朱氏认为，仙鹤草味苦辛而涩，涩则能止，辛则能行，是以止涩中寓宣通之意。考诸文献，《百草镜》中言本品“下血活血”、治“跌仆吐血”，《生草药性备要》谓其“理跌打损伤，止血、散疮毒”，《闽东本草》用仙鹤草治痛痈结毒，《滇南本草》有“治赤白痢”之记载，均可证本品之活血作用。盖乳痈与痛痈结毒，皆因邪毒结聚、气血壅遏所致，设其无活血之功，何能消之溃之？是为止血而不留瘀，活血治痢之佳药。他以仙鹤草、桔梗为主药，创“仙桔汤”治疗慢性痢疾与结肠炎，取其活血排脓止泻之功，用之多验。仙鹤草又名脱力草，江浙民间用此品治脱力劳伤有效，足证其有强壮之功。单用本品治疗气血虚弱之眩晕，有一定效果，即从其强壮作用引申而来，朱氏尝以仙鹤草配黄芪、大枣为基本方，治疗血小板减少性紫癜、过敏性紫癜，其效颇佳。
此外，仙鹤草尚有强心作用，叶橘泉先生著《现代实用中药》一书，曾提及之。此为一新发现，为过去文献所未记载。近年有用仙鹤草提取物（仙鹤草素）治疗克山病所致之完全性房室传导阻滞，用后心率增快，而迅速地改善症状。而其机理，殆与仙鹤草的活血作用有关。
又如朱氏用刘寄奴治瘀阻溺癃，刘寄奴味苦性温，入心脾二经，为活血祛瘀之良药。凡经闭不通，产后瘀阻作痛，跌仆创伤等症，投之咸宜。而外伤后血尿腹胀，用之尤有捷效。《本草从新》载其能“除症下胀”。所谓“下胀”者，因其味苦能泄，性温能行也。而“除症”之说，殊堪玩味，经验证明，此物对“血症”、“食症”等证均可应用。所谓“血症”盖因将息失宜，脏腑气虚，风冷内乘，血气相搏，日久坚结不移者也。在妇女则经水不通，形体日渐羸瘦，可予四物汤加刘寄奴、牛膝、红花、山楂之属。引申之，肝硬化腹水用之亦有佳效。而“食症”，则因饮食不节，脾胃亏损，邪正相搏，积于腹中而成。此物民间用于治疗食积不消。凡食症已成，或食积长期不消，以致腹中胀满，两胁刺痛者，以此物配合白术、枳壳、青皮等。见功甚速，大可消食化积，开胃进食。其“消症”之说，确属信而可证。
刘寄奴亦可治痢，《圣济总录》载：“用刘寄奴草煎汁服”，治“霍乱成痢”。历代医家沿用之，《如宜方》即以其与乌梅、白姜相伍，治“赤白下痢”。今人用其治疗菌痢颇验，想亦赖其化瘀消积之能也。此外，还以之治疗黄疸型肝炎，不仅可以退黄疸、消肝肿，并能降低转氨酶及麝浊。
朱氏对刘寄奴的应用，不仅如上所说。尝告我辈曰：“刘寄奴的活血祛瘀作用，可谓尽人皆知，而其利水之功则易为人所忽略，良药被弃，惜哉！”《大明本草》虽有其主“水胀、血气”之记载，但后世沿用不广，以此品直接作利水之用者，当推《辨证奇闻》“返汗化水汤”。此汤“治热极，止在心头一块出汗，不啻如雨，四肢他处，又复无汗”，药用：
茯苓30克、猪苓10克、刘寄奴10克。
并云“加入刘寄奴，则能止汗而又善利水，而其性又甚速，用茯苓、猪苓，从心而直趋膀胱”。这是对刘寄奴功用的另一领悟。朱氏认为，刘寄奴由于有良好的化瘀利水作用，因此可用于治疗瘀阻溺癃症，尤适用于前列腺肥大病引起之溺癃或尿闭。所谓溺癃，指小便屡出而短少也，久延可致闭而不通。而前列腺肥大则与瘀阻相关，凡瘀阻而小便不通者，非化瘀小便不能畅行。李中梓治“血瘀小便闭”，推“牛膝、桃仁为要药”。而朱氏则用刘寄奴，其药虽殊，其揆一也。
诸如上述，朱氏对药物功用的阐发甚多，有“庵闾子配楮实子消臌胀腹水”、“苍耳子有通督升阳之功”、“豨莶草具解毒活血之妙”、“生槐角润肝燥以定风眩”、“葶苈子乃泻肺强心之佳药”、“马鞭草祛瘀消积，清热解毒功奇”、“土茯苓治头痛，疗痛风”、“茅苍术升清气，除癖囊”、“石斛除痹奏佳效”、“补阴妙品楮实子”、“乌梅亦主暴痢”等等之说。
二、潜心研究虫药，重在应用发挥
朱氏潜心研究虫类药数十年，上自《本经》，下逮诸家，凡有关虫类药的史料，靡不悉心搜罗，然后结合药物基源、药理药化和实践效果，辨伪求真，大胆地加以引申发展，使一些虫类药的配伍与应用赋予了更深广的内涵，应用范围不断扩大。
如蜂房，《别录》谓其“治恶疽、附骨痈”，可使“诸毒均瘥”，能治“历节肿出”，故它是一味攻毒疗疮，散肿止痛的佳药。但在临床实践中，朱氏发现它能温阳益肾，用治清稀带下和阳痿不举，具有显效。凡带下清稀如水，绵绵如注，用固涩药乏效者，于辨证方中加蜂房，屡获佳效。
他认为：“带下清稀，乃肾气不足，累及奇经，带脉失束，湿浊下注所致。利湿泄浊之品，仅能治标，而温煦肾阳，升固奇经，才是治本之图”。他用蜂房温阳益肾，每每伍以鹿角霜、小茴香等通补奇经之药，配伍独到。若带下因湿热下注，又有肾阳不足见症者可在清泄湿热方中加用蜂房，亦可奏功。对阳痿证，除肝经湿热，致宗筋痿而不举者外，凡劳倦伤神，思虑过度，精血亏损，下元不足而致者，均可采用朱氏创订的“蜘蜂丸”治疗，该丸由花蜘蛛（微焙）、炙蜂房、紫河车、仙灵脾、肉苁蓉温肾壮阳，以振其痿；熟地、紫河车填补肾精，以复其损，为治阳痿不举之良方。朱氏强调蜂房与花蜘蛛虽同为温肾壮阳药，但花蜘蛛功擅益肾助阳，而蜂房则不特温肾，且对全身机能有强壮调整作用。朱氏还用蜂房治疗遗尿，亦重在温阳益肾以固本。用露蜂房炙存性，研极细末，成人每服3～6克，年幼者酌减，每日2次，黄酒或开水送下。凡遗尿久治不愈，症情顽缠，体质虚者，均可选用。此外，蜂房还有一种功效，鲜为人知。他用其治疗慢性气管炎，久咳不已，取其温肺肾，纳逆气之功。不仅高效，而且速效，确是一味价廉物美的止咳化痰药。每用蜂房末3克（小儿酌量），鸡蛋1只（去壳），放锅内混和，不用油盐，炒熟，于饭后一次吃下，每日1～2次，连吃5～7日可获满意疗效。
又如地鳖虫，朱氏认为它是一味性能平和的活血化瘀药，凡血瘀经闭，症瘕积聚，跌打损伤，瘀血凝痛，用之均有良效。其特点为破而不峻，能行能和，虚人亦可用之。他研制的复肝丸（地鳖虫、红参须、紫河车、广姜黄、参三七、炮山甲、鸡内金、虎杖、石见穿、糯稻根）治疗慢性肝炎或早期肝硬化，症见肝脾肿大、胁痛、面色晦滞、肝功异常、症情顽缠、久而不愈者，针对“久痛多瘀，久病多虚”及肝郁气滞，血瘀癖积的机理，方中以破瘀散结的地鳖虫为主药，配以消症破坚的三七、穿山甲，佐以行气解郁止痛的姜黄、郁金，伍以消滞健脾之鸡内金，复入清热解毒、活血止痛的虎杖、石见穿、糯稻根，更参用红参须、紫河车培本元，补气血，以扶正治本，达到攻不伤正，补不壅中，寓攻于补之目的。本市传染病院临床观察证实了该药能增强细胞免疫功能，能改善脂质代谢，增加肝脏血流灌注和供氧，促进肝细胞再生，减轻肝纤维增生，促使肝功能恢复正常，肝脾回缩，调节白、球蛋白的比例，使HBs Ag转阴率达75％，确是治疗慢性肝炎、肝硬化的一种有效药物。朱氏以地鳖虫为主药，还创续筋接骨合剂（地鳖虫、自然铜、骨碎补、当归、川芎、川续断、红花、赤芍、甘草），治疗各种跌打损伤，能活血散瘀，接骨续筋，加速骨痂形成；创健脑散（红参、地鳖虫、当归、甘杞子、制马钱子、制乳香、制没药、炙全蝎、川芎、地龙、紫河车、鸡内金、血竭、甘草），治疗脑震荡后遗症，能补益气血，活血化瘀，健脑迪智，促使早日恢复。还用地鳖虫治颈淋巴结核、妇女顽固性闭经、痛经等。浸润型肺结核、慢性纤维空洞型肺结核、肺结核咯血等病证基本属虚，但均有瘀滞的表现，朱氏创保肺丸治疗之。处方：地鳖虫、紫河车、百部、制首乌、白芨、生地榆、黄精、葎草，一般服用15～30天后即见效机，潮热、咳呛、咯血、盗汗，均显见减轻，血沉减慢，连服2～3月以上，病灶可趋吸收或闭合。此方从地鳖虫活血散瘀作用引申，扩展运用于肺结核久不吸收钙化者，意在推陈致新；百部润肺定咳，抗痨杀菌；制首乌滋补肝肾，并能“补肺虚，止吐血”（《本草从新》）；白芨补肺泄热，敛肺止血，逐瘀生新，消肿生肌；地榆凉血止血，清热抗痨；葎草清热解毒，消瘀抗劳；黄精补肾润肺，有抗痨之功，不失为病证结合、标本兼顾之良方。
朱氏还擅用虫药治疗疑难杂症，他曾治不少肿瘤患者，尤其是食道癌患者，效果较为显著。
朱氏认为食道癌在病理上有鳞癌、腺癌之不同，在辨证上有虚实之分。早中期多表现为气滞、痰聚、血瘀、毒踞的实证，晚期则因病程缠延日久，进食困难，而致气阴两亏，虚实夹杂。朱氏拟订通膈利咽散，由水蛭、炙全蝎、炙蜈蚣、炙壁虎、炙僵蚕、炙蜂房、制海藻共研细末而成，每服5克，每日3次，用西洋参（阳虚气弱者用红参）煎汤送服，治疗中晚期食道癌，有的能控制进展，有的可以临床缓解，延长生存期。上列虫类药均有消坚破结，解毒化瘀之功，西洋参补益气阴，提高机体抗病能力，扶正祛邪冶为一炉，宜其功宏。
朱氏认为，虫类药的应用具有十分广阔的前景。要通过不断的实践探索，去发掘新药，开辟应用的新天地；要注重剂型改革，做到既方便应用，又提高疗效；还要通过人工培养动物的方法，保证紧缺药物的供应，使之更好地为人类的健康服务。朱氏的专著《虫类药的应用》自问世以来，得到广大医务工作者的青睐，此着对虫类药的临床应用，科学研究以及广开药源上起到很大的推动作用。
三、酌古参今，病证结合，研制新方
朱氏处方用药一贯主张辨证与辨病相结合，在这一学术思想指导下，不断研制出新方，从而提高了临床疗效。
如以黄芪配莪术为主治慢性胃炎。慢性萎缩性胃炎是一种慢性消耗性疾病。胃为五脏六腑之海，气血生化之源，胃病既久，化源匮乏，气衰无力，血必因之瘀阻，因此常呈胃气虚衰，瘀阻作痛之候，朱氏认为此病证应选益气活血，化瘀生新之品，方能奏养正消瘀止痛之功。朱氏自创“胃安散”，处方：
生黄芪90～120克，莪术30克，党参、怀山药各90克，鸡内金、炙刺猬皮、生蒲黄、五灵脂、徐长卿各60克，炮山甲、玉蝴蝶、凤凰衣各45克，甘草30克，共研细末，每服3克，一日三次，食前半小时开水冲服。
方中黄芪、莪术为主药，朱氏指出：“黄芪能补五脏之虚，莪术善于行气、破瘀、消积。莪术与黄芪同用，可奏益气化瘀之功，病变往往可以消弭于无形。因为黄芪得莪术流通之性，补气不壅中；莪术得黄芪之气旺，攻破而不伤正。两药相伍，行中有补，补中有行，相得益彰”。方中党参、山药助黄芪益气养胃，健脾助运。鸡内金、刺猬皮、炮山甲、蒲黄、五灵脂助莪术活血行瘀，软坚散结，对慢性萎缩性胃炎的病理改变，胃粘膜腺体萎缩、粘膜变薄，甚至肠上皮增生或粘膜非典型增生等症有明显的治疗作用，能改善微循环，调节代谢失调，调节神经血管营养，促使增生性病变的转化和吸收。鸡内金还有健脾开胃，消化食积之功，现代药理研究表明，口服鸡内金后，胃液分泌量、酸度及消化力三者均见增高。徐长卿善于行气消胀，缓急止痛。凤凰衣、玉蝴蝶二药素有养阴清肺之功，除善治久咳、咽痛、音哑外，还有补虚宽中、保护胃粘膜及促进食欲之功。全方益气消瘀，和胃止痛，此为基本方，偏阴虚者加北沙参、麦冬各60克、生白芍90克；偏阳虚者加高良姜、炒白术各60克、荜拔30克。
随证制宜，临床使用屡屡获效，胃痛多趋缓解、消失，食欲显著增加，病理变化随之改善或恢复正常。《本经》首言生黄芪善医痈疽久败，能排脓止痛；次言大风癞疾，五痔鼠瘘，皆可用之。性虽温补，而能疏调血脉，通行经络，驱风运毒，生肌长肉，以其伍蓬莪术，恒收祛瘀生新之功。故临床运用可使器质性病变之病理性变化获得逆转。如朱氏还用之治消化性溃疡、肝脾肿大，肝或胰癌肿，颇能改善病灶的血液循环和新陈代谢，以使某些溃疡、炎性病灶消失，肝脾缩小，甚至使癌症患者病情好转，延长存活期。具体运用此两味药时，往往根据辨证施治原则，灵活掌握其剂量、配伍，如以益气为主，黄芪可用30～60克，再佐以潞党参或太子参；如以化瘀为主，莪术可用至15克，亦可加入当归、桃仁、红花、地鳖虫等；解毒消症常伍参三七、虎杖、蛇舌草、蜈蚣等。
又如水蛭一药，《本经》谓其“主逐恶血、瘀血、月闭、破血症积聚，无子，利水道。”是一味活血化瘀，消症破积的佳药。朱氏用之治疗肿瘤、腹部症瘕积聚，如子宫肌瘤、卵巢囊肿、宫外孕等，还用于治疗风湿性心脏病、心绞痛、心肌梗塞等瘀血征象明显而正气不太亏虚者，以及门静脉高压脾切除术后血小板增多症、颈淋巴结核等，屡获佳效。朱氏结合现代医学、药理药化，近年来用本品治疗高血粘、高脂血症，获效较速。水蛭新鲜唾液中含有水蛭素，能阻止凝血酶作用于纤维蛋白元，阻止血液凝固。水蛭分泌的一种组织胺样物质，能扩张毛细血管，缓解小动脉痉挛，减轻血液粘着力。他创订的双降汤［水蛭（研末吞服）、广地龙、黄芪、丹参、当归、赤芍、川芎、泽泻、生山楂、豨莶草、甘草］，治疗高血粘、高血脂或伴高血压者尤宜。此类病人多表现为气虚夹痰瘀之证候。气虚血运无力，血流不畅久而成瘀；气虚运化无能，膏粱厚味变生痰浊、气虚痰瘀互为因果，络道被阻致诸证蜂起。方中用水蛭、地龙破血逐瘀为主药，合丹参、当归、赤芍、川芎活血通脉；山楂、泽泻、豨莶草降脂泄浊，且能降压；重用黄芪补气，取其气生则血生，使血循畅达，且可免破瘀伤正之弊。临床研究证明本方具有改善血液流变性，改善微循环，增加血流量，改善血液粘稠度，改善脂质代谢等作用。服后既可降脂通脉，降粘降压，防止心脑栓塞、梗阻，又能减肥轻身。如治陈某某，女，54岁，教师，形体肥胖2年，近3月来头昏渐加重，在某医院查血粘度高粘（＋＋＋＋），总胆固醇87mmol／L，微循环重度障碍。患者头昏而重，四肢乏力，口干，舌红苔薄、根微腻，脉细涩。证属气阴不足，瘀浊内阻之候，治予补益气阴，化瘀泄浊。用双降汤方加川石斛、全瓜蒌。服10剂后，患者觉全身舒适，头昏重渐释，惟尚有口干，予上方去全瓜蒌，加生地、杞子，又服10剂，药后觉头清目爽，诸症消失，自觉腹围较前减小，续服双降汤方30剂后，停药半月，复查血粘度正常，总胆固醇36mmol／L，微循环基本正常，腹围减少45cm。嘱患者隔日服1剂，巩固治疗。
