李氏注重经穴疗法在针灸治疗上的重要作用，在潜研历代针灸学家的学术成就上，倡导“在辨证论治原则下的经穴疗法”。在理论上指出：经络是脏腑的枝叶，脏腑是经络的根本，脏腑舍于经络之中，经络寓于脏腑之内，互为依存，故外而五官九窍，内而五脏六腑，膏肓膜原，或四肢百骸及全身性疾患等，皆可以取经穴治之。“无经络则脏腑神机化灭，无脏腑则经络气立孤危。”足见脏腑与经络之互相依存的重要关系。
一、经穴疗法治疗血证
此法缘于“血会膈俞，肝藏血，脾统血，肾纳血”之理论。血者，阴也，为中焦受气取汁变化奉心而赤者也。血归藏于肝，统摄于脾，纳贮于肾。李氏治疗消化道大出血、崩漏出血不止等阴竭阳脱之危候，常以重灸百会、涌泉以回阳固脱，益气救逆，再分别配以膈俞、肝俞、脾俞、肾俞、命门、中极、关元等穴以治其本。李氏对虚寒性出血，常以大艾条法治疗，其法是用2～3根艾条为一束点燃即为大艾灸，于经穴上悬灸，重灸持续15分钟以上，至经穴皮肤潮红为度，务使药热内达深透，其效有三：温灸腧穴调节经气以行血而止血一也；温阳（气）以摄阴（血），使阳（气）潜而阴（血）敛，血循脉道而血自止二也；温通血脉以消瘀止血三也。本法证之临床，颇有良效。如治周某，女性，41岁，因患“宫血”大出血不止而住院，经输血、止血，及支持补充血容量等治法，仍出血或崩或漏不止，患者面色㿠白无华，汗出气短而神少虚弱，脉芤细而数。即于当日上午予针膈俞、肾俞行补法，并用大艾悬灸关元，至半夜即见血止，病者面渐红润，脉转和缓，汗出亦止，守法调治一周，合以中药益气摄血之品而收功。此用经穴温灸可令阳气回复而阴血摄敛，冲任平调则血归经入海也。
二、注重特定穴的选用
凡疾病之发，有发于阴，有发于阳，有病在脏在腑，在气在血，在筋在骨等的不同，分别选用有特殊治疗作用的五输穴、原络穴、八脉交会穴、八会穴、郄穴、下合穴等特定穴治疗。这些特定穴具有调节所属脏腑的生理功能，而且该脏腑有病常会在相关的特定穴有压痛感。故此特定经穴既可作为疾病的诊断依据，又可作用于疾病治疗的经穴。如血液病可选膈俞治疗，髓的病选绝骨治疗，筋的病选阳陵泉治疗。腑病取中脘，脏病取章门，心胸胃的病证取内关、公孙治疗等等。
三、注重经穴配伍的补泻作用
凡人体经络脏腑皆一气流注，经气在人体是不可分割的，因而经穴的配伍对机体有整体调节和局部调整相结合的协同气化作用，表现为补泻的不同功效。所谓补其不足，泻其有余，从而建立阴平阳秘的正常生理状态。
五输穴配五脏、五行的关系而应用，这是根据《难经·六十四难》提出五输穴配以阴阳五行，阳刚阴柔，阴阳相合，刚柔相济，阴阳互相克制的关系。凡阳经井穴属金，阴经井穴属木，阳经按金水木火土次序排列，阴经按木火土金水次序排列。阴阳经五输穴配五行的母子关系，阴经井穴属阴干乙木，阳经井穴属阳干庚金，以阳合阴，以刚济柔，故庚者乙之刚，乙者庚之柔，其他各经仿此类推。其补泻方法有：
1．本经本穴补泻法：如肺经虚证用补法，补经渠穴；肺经实证用泻法，泻经渠穴。因肺属金，经渠穴也属金，故称本经本穴补泻法。
2．本经补母泻子法：如肝经实证，表现头痛、目眩、目赤、肝阳上逆，实者泻其子，肝属木，木生火，取本经火穴行间泻之。肝经虚证，表现头昏，面色萎黄，肢软，肝血虚，虚者补其母，肝属木，水生木，取本经水穴曲泉补之。
3．表里经补母泻子法：如肺实证，表现喘咳、胸满、气粗。实者泻其子，取大肠经的水穴二间泻之。肺虚证表现喘咳、汗多、短气，虚者补其母，取大肠经土穴曲池补之。
4．母子经补母泻子法：如肺实证，取肾经水穴阴谷泻之，因肺属金，金生水，水配肾经之故。
肺虚者，取脾经土穴太白补之，因肺属金，土生金，土配脾经之故。
