刘氏认为：脑病的病因虽然很多，其常见因素为外邪、痰、瘀、内风、气郁、正虚六者而已。
由于外邪有风、寒、火（暑）、湿之殊；痰有痰湿、痰热之分；瘀有阻络、扰神、闭窍之别；内风有肝阳化风、热盛风动、阴虚风动、血虚风动之异；气郁有郁滞、郁热之分；正虚有精虚、气虚、神虚之异，均宜一一区别。
一、因于外邪
外邪，即为六淫，风、寒、暑、湿、燥、火是也。但作为脑病病因来说，主要有风、寒、火（暑）、湿四种因素。
风为六淫之首，常兼夹寒邪或热邪，经口鼻或肌表而入，内侵于经络，上犯于巅顶，动扰于清空而致头痛，或风犯于外，扰于内，引动内邪而诱使脑病发作。
寒邪有伤寒、直中之分，若天寒地冻或气温骤降之时，人受其寒，寒邪循经上犯巅顶，或大寒直中于头部，均引起头痛。正如《素问·奇病论》所说：“当有所犯大寒，内至骨髓，髓者以脑为主，脑逆故令头痛。”火邪有二，或外感六淫之火（暑），或外感他邪而郁遏化火，或火邪逆传而内陷于心、肝，或上闭心窍而神昏谵语，或内动肝风而抽搐直视，皆为脑病之危重证。
湿邪外受，阻遏气机之宣发，影响头部气机的敷布，从而出现头重如裹、眩晕痛昏之疾。
二、因于痰
脑病之起因于痰者，其痰为无形之痰。一般认为：在肺、脾、肾及三焦脏腑气化功能失常，水液代谢障碍，水津停滞而形成痰邪之后，则可阻滞脑络、蒙蔽神窍而导致脑病。若痰郁化热，痰热上扰神明，亦可导致脑病。
三、因于瘀
瘀，指血行不畅或离经之血停积。刘氏尝曰：脑为元神之府，血脉和畅则神得昌宁，血脉不畅则神不安宁而痛、晕、呆、痫、厥诸症均可作矣。
一般而言，若头部突受外伤，血脉运行受阻，或气机阻滞，运血不畅，血脉自痹；或年老体弱，全身功能日渐减退，血脉运行日渐涩滞；或风阳升扰，影响头部气血运行之道，血溢于外而成离经之血，皆可使头部血脉运行失于流畅，甚至瘀塞不通，从而影响脑的正常功能，导致脑病的出现。
四、因于气郁
气流行于全身各处，无处不有，时刻推动和激发着人体各组织器官的生理活动，因此脑的生理功能也有赖于气的推动和激发。
若神志抑郁不畅，或过用滞气的药物，均可使气机郁滞于脑，从而导致脑病。若气郁化热，郁热上升，动扰神明，亦可导致脑病。若暴怒可使肝气横逆上冲，血随气逆，并走于上，亦可见头痛、昏厥、卒倒等脑病症状。
五、因于内风
内风出自于肝，多由肝阳及热盛、阴虚、血虚所产生。若素体肝阳偏盛，肝阳上亢，或长期忧思恼怒，气郁化火，使肝阴暗耗，风阳升动，上扰清空，发为脑病。或肾阴亏损，肾水不能涵养肝水，以致肝阴不足，肝风内动，亦发为脑病。
六、因于正虚
虚，主要指正气不足，是指以正气虚损为矛盾主要方面的一种病理反映。刘氏认为：当虚成为脑病的致病因素之时，主要指精、气、神的不足。精虚在于肾，气虚在于脾，神虚在于心，故脑病之虚，多乃肾、脾、心之亏损也。此乃脑病虚证之根源。
精藏于肾，肾精足则能上充于脑，使脑髓充满而能尽其所用，故《灵枢·经脉》曰：“人始生，先成精，精成而脑髓生。”《大小诸证方论》亦曰：“肾气上通于脑，而脑气下达于肾，上下虽殊，而气实相通。”若素体禀赋不足，或劳倦过度，或房事不节，或久病失养，皆可耗伤肾之精气（阴精或阳精），肾精亏虚而不能上充于脑髓，则脑髓不能充满，脑失其用而脑病作矣。并且肾之阴精受损，既可水不涵木，虚风内动，导致脑病，又可因水亏而不能上奉于心，水不济火则心火独亢，心神受扰而出现失眠、狂躁等神志不宁症状。
气生于脾，脾运健则谷气充足而灌溉于全身，升清于头部，头得谷气之充，则脑髓满而能尽“精明”、“记性”之用。若饥饱劳倦所伤，影响脾之运化，则谷气不足而不能上升其清气，上气不足则影响脑髓之满，从而导致脑病，即《灵枢·口问》所谓：“上气不足，脑为之不满，耳为之苦鸣，头为之苦倾，目为之眩。”神藏于心，心得气血所养，则其主神明的生理功能正常，从而精神振奋，神志清晰，思维敏捷，反应灵敏，即脑之功能正常。若禀赋薄弱，或病后失调，或思虑过度，导致心之气血不足，也就能影响心主神志的生理功能，出现神虚之象，即见反应迟钝、失眠健忘、精神委顿等症状。
虽然脑病常由外邪、痰、瘀、气郁、内风、正虚六者引起，但它们很少单一为病，通常互相兼杂，互为因果。如外邪稽留不去，可以影响水液之输布而生痰，影响血液之运行而生瘀，影响气机之通畅而致郁，影响肝阳之潜降而动风，日久不愈，亦可影响肾脾心之功能而伤精、伤气、伤神。痰之为病，亦可阻于脉道而导致瘀血，滞于气机而导致气郁，阻于脏腑而引起正虚。瘀之为病，可使水液失于输布而生痰，使气机运行不畅而郁滞，使肝脏失于柔润而动风，使脏腑受损而伤正。气郁、内风之为病，均能影响水液之输布、血液之运行而使痰、瘀之邪内生。正虚之为病，虚而不能固护于表则易感外邪，虚而不能运化水液则内生痰浊，虚而运血无力则导致瘀血，虚而不能柔润于肝则内生肝风。因此这六者虽然是脑病由来之源，但由于它们之间的互为因果，导致了脑病病症的错综复杂。
综上可知，脑病病因虽多，不外乎外邪、痰、瘀、气郁、内风、正虚六种因素。刘氏认为：脑部感染性疾病一般起因于外邪，急性期多兼痰、兼内风；恢复期则多为痰、瘀、内风三者互结，或伤及于正所致。脑部缺血性疾病，一般起因于瘀与内风，急性期可兼痰或气郁，亦有化火者；恢复期则多为正虚、血瘀所致，亦有兼夹内风或痰浊者。脑部出血性疾病，一般起因于内风，急性期可兼痰、兼瘀，亦有化火者；恢复期则多起因于内风、痰浊、瘀血、正虚。脑部损伤性疾病，虽然起因于瘀血，但急性期可有兼痰或化热之变，恢复期则乃正虚、血瘀等因素为病。脑部占位性疾病，一般乃痰、瘀为病，常兼夹内风，日久不愈者渐伤于正。脑部先天性疾病，常因正虚而致病，尚可兼夹痰、瘀及内风。脑部变性疾病，一般起因于正虚与血瘀，亦兼痰、兼内风者。脑部发作性疾病，多起因于内风、痰、瘀，亦可与外邪、正虚有关。精神病变，则多起因于气郁、痰、瘀与正虚，亦可有化热之变。因此刘氏认为脑病病因主要责之于外邪、痰、瘀、气郁、内风、正虚等六个方面。但六者之中，以内风、血瘀、正虚为病者居多，以外邪、痰湿、气郁为病者较为少见。
