脏腑是人体生命所依，疾病所系之处。所以脏腑辨证是很重要的一环。
陈氏尝云：人体发病，是一定的致病因素作用于人体后，反应出现的一群证候，其所侵犯的脏腑部位不同，就会出现不同的证候，这即是进行脏腑辨证的重要依据。但是人体是一个统一的整体，脏腑之间生理上相互依存，相互联系，疾病发生后也会使脏腑之间相互传变，相互影响。临床上通过四诊收集到的资料，经过归纳、综合、分析而确定诊断病变的脏腑部位以及脏腑之间相互影响。如，治一吴姓哮喘患者：哮喘冬日发作十余载，近日又发，喘促发憋，早晚较重。喘时不能平卧，咳嗽痰多白粘，呼多吸少，气不得续，动则喘甚，气短自汗，心慌少寐，唇甲青紫，且见烦躁不安，胸闷善太息，纳差便溏，尿频，下肢浮肿，舌质绛，舌苔白，脉沉弦细数。细析该脉症：喘促日久，反复发作，咳嗽痰多白粘，乃浊痰内阻，气道不畅，肺失肃降，其病在肺；喘重不能平卧，气不能续，呼多吸少，动则喘甚，脉细沉，乃肾失摄纳，其病在肾；肾为水脏，肺为水之上源，今肺肾两虚，水津乏源，则水不制火，而心火亢，心阴耗伤，阴血不足，血行滞涩，脉络瘀阻，出现心慌气短少寐，唇甲青紫，舌质绛；肝肾同源，肝肾阴虚，肝火旺盛，故而烦躁易怒，胸闷善太息，脉弦数。肾为水火之脏，阴阳之根，若阴损及阳，致命门火衰，失于温煦，脾阳不足，温运失司，故有纳差，腹泻便溏，下肢浮肿之症。由此可见，不论什么疾病，均有累及脏腑的可能，须根据各脏腑发生病变的临床特征详加辨证，并要注意脏腑病变相互传变和消长的规律，而防患于未然。
在脏腑辨证中，尤应注重脾胃在人体生理病理中的重要作用。尝云：五脏之根本乃脾与肾，肾为先天元阳之本，脾为后天精血之源，只有先天之本固，后天之精血充，才能使生命运转不息，生生不绝。肾又为水火之脏，肾阴肾阳为人体阴阳之根本，肾阴充盛则生髓濡胃，滋养五脏之精血，肾阳充和则温煦万物，使人体生机旺盛，正常地生长、发育、繁衍生息；脾主运化，向五脏输布水谷之精微；胃主受纳，传代谢之糟粕，对于脾胃的关系是一升一降，循环往复，两者既有分工，又有合作。因此在治疗脾胃病时要充分注意到它们之间相互合作和补充，相互依存的关系，又要注意到它们之间的区别和特性。胃为阳土，脾为阴土，胃阳赖脾阴以濡养，脾阴赖胃阳以温煦，故治胃与治脾不同，治腑与治脏各异，脾喜燥而恶湿，温补则健；胃喜湿而恶燥，濡润则和。温脾常以四君、六君、香砂六君、参苓白术、补中益气之类；润胃常用沙参、麦冬、石斛、山药，热病后期常用五汁饮之类。肾病有阴阳水火之异，肾阳虚常以桂附地黄、鹿茸或右归之类温补肾阳，所谓益火之源以消阴翳；肾阴虚者常以六味地黄、麦味地黄、大补阴丸、左归之类育阴清相火，填补肾精，以图壮水之主以制阳光之功。此乃脏腑辨证中尤重先后天的意义所在。
