祖国医学将心分为神明之心和血肉之心。前者是指脑神经而言，后者指心脏而言。
心位于“肺下肝上”、“形如未开莲花”。“心为诸经之主……而血脉，脉气流于诸经”。“此一主者，气血之根，生化之本，十二经之网维”。“人心动，则血行于诸经”。所谓肺下肝上，是指心脏居胸腔，大如拳。“左右有肺”，“心尖略向左”，“色赤而鲜”，“体外圆滑，内腔如囊，中有横直膈膜相隔如户如房”，心脏主持血液循环。以肝的疏泄阳气，肾脏的阴精上交于心，借着自然界的诸阳之气渗透于中，转化为心气，在心气的鼓动和神明的调节下，使心脏不断地发生节奏性跳动，将血液输入血脉，循环于机体，然后由全身各处汇集的“各经之血，无不上会于肺”，从而构成机体的大小循环，担负着“食气入胃，浊气（精气）归心，淫经于脉，脉气流经，经气归于肺”，“肺主呼吸，司清浊之运化”的任务，保证了人的正常的生理活动。
心与其他脏腑的关系心与肺心肺为阳，同居于胸中膈上，肺主气，心主血，气血相依，相互为用，相互促进，构成气得以濡之，血得以煦之的生理活动。气机所动受血液滋养而不亢不燥，推行血液循环于全身，内濡脏腑，外养四肢百骸；血赖气的熏蒸而动，循行不息，从而形成肺主气，以呼吸清浊，推行营卫，施布津液；心主血，以运行营养物质，供机体生理之用，此谓：“心主血，肺主气，血为营，气为卫。
相随上下，调之营卫，通行经络，营周于外，故令人心肺在膈上也。”心与脾心居胸上处于上焦，脾居于腹处于中焦，以募原和脾支脉构成气化机能之用。心阳和营精下济于脾，则脾气得充，阴精得助，阴阳相交则转化为元气。元气生，则中轴得定，运化之机得畅，胃气得行，升降机能得以斡旋于上下。水谷得化，津液以布脾血得以统运，营气以行，上布于心，心营得资，心体得养，则神气安宁，血气乃和，此谓“心之脾胃”之用的机理。
心与肝心与肝的生理关系是以气血为用的，因肝脉的分支络于肺，吻合于心脉，则成“心肝气通”。
心主营运的血液藏于肝，肝体阴用阳，其性刚劲，主动，主升，得心输其血精以濡润之，刚劲之质得以柔和之体，以布升发之阳，此谓“阳潜于阴、阴出于阳”之理；肝体柔和，生阳畅茂，疏泄之机得通，心受其气，则心气得充，心阳得助，血液得行，营卫得布，津液得散，机体得养，脏腑得滋。
此为“清净之气……生于肝……役于心”之义。
心与肾肾的支脉，络于心脏，以成心肾相交，升降相因，阴阳相济的关系。心阳转化为心气，是以肾阴上交于心，则阳得阴而化。心气温润、血液得行，此为心阳动而火不亢。肾阳转化为肾气，是以心阳下济于肾，则肾阴得阳而生，肾之真气，上通脏腑，以为生理之用，此为心肾相交之理。
心与小肠心是从少阴之脉络于小肠，而小肠经脉也络于心。因而构成心与小肠在生理上互为表里，阴阳互用。心为阴火为君而主静；小肠为阳火为相主动，动静相合则蒸精化液而生冲和之气。
因此，心有此气则心动不疾不徐，以行血液循环之用，其脉乃调，神则内藏，心动有节，以营、精、津，注入机体，脏腑得润，皮、毛、筋、骨得濡；小肠得此气，则行受盛之用。以济泌别，上供心脏之需，内滋心火；下济它脏它腑，以滋身体，则生理活动若一。
心与胆心与胆相通，心为君火“经与上生于下”而为阴，阴主静，静则为柔；胆为相火，位于下而为阳，阳主动，动则为刚，从而在生理上形成刚柔相济，阴阳互化升降相关，清浊已分，清浊之间是为少阳升阳之气。而升阳之气以助中气（木疏于土则运）。中气者，阴阳升降之轴，气血循行之枢。少阳升发之气借此枢轴上升于心，则心阳有助，心气有资，以行于血，血得煦，则营运于精、气、津以供生理之需；君火之气借此枢轴下降于胆，则胆之少阳升发之气得血以濡之，津以润之。虽为相火之体，而其气不燥而生冲和之气以供之用，故《素问·调经论》说：“五脏之道，皆出于经隧，以行血气。”黄坤载亦说：“阴阳则有清浊，清则浮升，浊则沉降，自然之性……，清浊之间是为中气者，阴阳升降之枢轴。”此即所谓心病治胆，胆病治心的道理。
综观上述，心与五脏六腑生理功能是相互为用的，故心病则神摇，神动则脏腑不安，心神不宁而疾甚矣。故《推求师意》说：“心动则心之所以为病，病则有因，因者，内外之邪所致。”
一为先天所致。因先天禀赋不足，心内如房如户之体不全，而引起血行不畅，内蓄瘀血于心，瘀血内结，血不舍神则神气外浮而成心悸、怔忡之患。
二为风寒湿邪或风湿热邪乘机体。正气不足，卫气不固，腠理不密六淫之邪侵入肌腠，流入关节。久而不除，则邪气深犯于脉，发为脉痹。内舍于心，导致脉气不通，心体受损，房户伤，而生心痹。“烦则心下鼓，暴上气而喘，嗌干善噫，厥气上则恐。”三为湿热病毒作用于咽，渗入营血，浸淫于心，久则心体受伤，体伤则气耗，耗则不能养神，而生怔忡、短气之疾。
四为素体禀赋不足或病后虚弱所致。精血不足，或病后虚弱所致，津血内虚，心体失养，心神不能内藏，动摇于外，则呈心悸之患；亦有损伤于阳，阳虚则气虚，虚则不能生神。导致神气内空，心无所主，故心悸作矣。
五为情志所伤，情志发疾有四：一者喜怒不止，怒而不止，郁闭肝气，不能疏泄于外，内逆化火，气火相结，扰于内则魂魄不安反上逆，触犯心神则不宁，心悸乃发。二者思虑日久，或饮食劳倦过度，损伤于脾，脾伤不运，斡旋无力，升降阻滞，发生清者难升，浊者难降，引起气血生化无能，气血匮乏不能上奉于心，故使心乏清气资养、精津滋润，神不能内守而生心悸之患。故周慎斋曰：“脾既不转输，则心亦无以奉生而化赤。”又曰：“心之脾胃虚则气不到于心，心则无成，亦不奉生”。三者为暴喜伤阳。“喜出于心”，阳伤则心气弱，弱则火衰；或肾虚久亏，亦有先天肾水不足；或过恐，或房劳伤肾，肾伤则水弱精虚，从而在生理上形成了心火弱不能吸收肾水上升于心，肾水不足则不能引心火下降于肾，造成水火不济，心肾不交，相火不能下潜，反而上腾冲击于心，神摇于内而呈心悸、怔忡之病。故周慎斋曰：“神者心也，气者肾也。”又曰：“欲补心者须实肾，使肾得升；欲补肾者，须宁心，使心得降。”即为上述之义。四者为“惊吓则胆伤”。少阳春生之气乏，心失少阳升发之气资助则心气乏，“内动于心，心动则神摇”，“心无所依”而病心悸怔忡之患。
六为久患肺胀、喘咳之疾，肺体受损，体胀气逆于内不能宣发于外，肃降于下，残留于肺，引起经气不畅，络血不通，使心气滞，血行不利，滞留于心，久则肺心同病而呈喘，悸不得卧，此为《巢氏病源》“肺气虚极，邪则停心”之理也。
七为久食膏粱厚味，脂液内生，渗入营血着于血脉，留而不去，久则脉体不柔，心之毛脉行血不利，清气内乏，心体失养，而生心痛或真心痛，亦有气不足或心阳不振，或心气阴滞，或大寒犯心，引起心与血脉功能失调，形成瘀血阻络，心乏清气之养，津血滋荣而生真心痛。
八为亡血竭气或肾精亏耗不能生髓，髓虚不能生血，血少则不能养心，则心动神无所归，而病心悸怔忡。
九为久患心痹、真心痛，肺心同病，心体损极，心阳内乏，心气内脱，血气不能通达四末，经络瘀滞，而生心衰之危候。
其它如瘿气、白喉、热毒犯心、药物中毒等等，损于心而成心疾。
