”陈氏临证时，非常强调辨证论治，并在此基础上，不断发展创新，倡言“以辨病为核心的辨证论治”，是其一大特色。
一、触机而发，仲景启迪
陈氏精研《伤寒论》数十年，尤其注重以其理论指导临床实践，强调要理用结合。对有些方证条文的理解认识，不囿于传统解释，常常触机而发，别有会心，并从中得到启迪，进而指导临床实践。陈氏提出“以辨病为核心的辨证论治”思想，即源于研究《伤寒论》的结果。仲景创立的附子泻心汤，方中即有消痞泻热的大黄、黄芩、黄连，又有温经扶阳的附子，寒热并用。陈氏对此方证是从局部与整体的关系中去理解认识的，可谓掘幽探隐，启人思维。他认为方中大黄、芩、连是针对局部病变心下热痞而设；而配以附子是针对病人素体阳虚。芩、连、大黄治疗病变局部，附子顾及全身整体情况，将局部与整体统一于辨证论治中。这一启迪，通过在长期的临床实践中摸索，逐渐形成了“以辨病为核心的辨证论治”思想，并有效地指导着临床实践。
二、病证认识，协调统一
在病、证的局部与整体认识上，陈氏认为：“证”与“病”有区别，“证”是由相对的脉象、症状、体征组成的，具有阶段性；“病”则有它一定的发展变化规律，属于全过程。凡是一种疾病，必定有它一种起决定作用的根本矛盾，并贯穿于疾病的始终。疾病的特殊本质亦由其根本矛盾所决定。基于此，病与病之间才能区分，鉴别诊断始能进行。不同疾病的特殊本质，决定了不同疾病发展的各自表现和规律，故病有定势。证不同于病，证是疾病发展过程中不同阶段表现出来的主要矛盾。陈氏指出：“病有定而证无定，病不变而证常变。”治疗疾病只重视解决病程阶段中的主要矛盾是不够的，还要重视解决贯穿于疾病始终的根本矛盾。
从辨病与辨证看，辨病侧重于局部病变分析，而辨证侧重于全身整体情况，因此“病”多是局部病变的反应，“证”则是整体的、综合的、动态变化的过程。病变的局部与全身整体情况，有时表现是一致，有时表现并不一致，怎样在治疗中正确认识两者的关系？陈氏提出了“以辨病为核心的辨证论治”比较好地解决了这一问题。一方面注意围绕病变的局部（这里的局部病变有两方面的意思，一是中医所指的局部，如心下痞、下利、头痛等；一是指西医的诊断，如肾炎、肝炎、冠心病等），或施与专药，或辨病论治，另一方面始终密切注意全身整体情况，辨证论治，两者的有机结合，即是陈氏这一学术思想的体现。
三、辨病为核心，结合整体辨证
1．结合辨病，借用西检：清·徐灵胎指出：“欲治病者，必先识病之名，能识病名而后求其病之所由生，知其所由生又当辨其生之因各不同，而症状所由异，然后考其治之之法，一病必有主方，一方必有主药。”（《兰台轨范·序》）现代名医岳美中教授也指出：“在辨证论治规律的临床运用中，不仅要辨证候的阴阳表里虚实寒热，还要进而辨病名（包括中医与西医病名），辨识疾病的基本矛盾所在。”（《岳美中论医集》）陈氏临证体会尤深，他说：明代吴又可早在《瘟疫论》中就指出，一病有一病之毒。辨识疾病，认清疾病的根本矛盾是必不可少的。在辨病方面，陈氏重视西医局部分析的化验检查，既将之作为诊断局部病变的参考，又不囿于西医检查诊断的束缚，而是西为中用，始终用中医的观点去分析、判断和立法处方。如西医化验检查血象高，称为“感染”、“炎症”，陈氏从不简单对号入座地理解为热毒。陈氏谓：毒分阴毒阳毒、寒毒热毒、水毒火毒、湿毒疫毒等，岂能一见“感染”，就为热毒？这是以偏概全，曲解了中医的意思。但是，临证时陈氏又重视西医化验检查，以帮助明确局部病变部位、性质，如咳血病人，常借助西医检查手段，借以弄清是支气管炎、支气管扩张引起，还是肺结核、肺癌导致？帮助明确诊断。对于肝炎、肾炎等慢性病的无症状期，更是重视西医生化指标，借助化验检查，认清疾病的根本矛盾所在，西为中用，发展中医。例如：治疗乙肝，特别是治疗临床症状不明显者，常结合西医化验检查选方用药，如HBs Ag阳性，而且滴度较高，HBe Ag阳性，SGPT亦升高者，常选用清热解毒之品，药用虎杖、茵陈、贯仲、丹皮、夏枯草、焦栀等；当病毒DNA多聚酶降至正常，HBe Ag从阳转阴，而抗－HBe尚未出现时，则通常选用益气健脾，补肾温阳之品，如人参、黄芪、白术、枸杞、淫羊藿、菟丝子等。陈氏经过多年实践探索，对久患肝病、迁延型肝炎、或早期肝硬化，用自拟“复肝散”有较好的疗效。又如：治疗肾病综合征的少症状期，若尿中蛋白多者，采用益气健脾，清利湿热，兼以固涩之法，常选用黄芪、玉米须、八月瓜、蛇倒退等；红细胞多者，凉血止血，加白茅根、炒蒲黄、血余炭等；白细胞多者，清热解毒利湿，加二妙散、红藤、忍冬藤等。借用西医检验，使中医有“证”可辨，并将辨证论治引向微观化。
2．审查局部，重视腹诊：陈氏重视局部病情的辨识，除了借助现代科学仪器和方法检验出的客观数据外，常常还通过自己主观望诊、切诊来掌握局部病变情况，陈氏强调这是施用以局部病变为核心的辨证论治中的重要环节，绝对不能忽视。如治疗小儿咳嗽，陈氏一般都认真观察小儿咽喉情况，他指出：小儿咳嗽原因众多，但有一点必须注意，不少小儿是咽喉疾患引起的刺激性咳嗽，纯用止咳化痰、宣肺等法多难收效，若检查明确针对病情采用清利咽喉的方法则每每建功。
在审查局部病变时，尤其重视腹诊。陈氏尊崇《伤寒论》，受到论中“心下满”、“心下有水气”、“按之濡”、“按之石硬”等切诊的启发，近年来在与日本汉方医的交往中又受到日本汉医腹诊的影响，对腹诊的重要性给予了充分的肯定，他认为腹诊对于诊断腹腔局部病变确能提供重要的参考帮助。腹腔中包含多个脏腑器官，肝、胆、脾、胰、胃、肠、子宫、卵巢、膀胱等均在其中，有时病人一句“肚子痛”即概括了病情，医生若不认真审查触切局部，往往是误治的主要原因。
例如：跟师随诊中，曾遇一女性病人，腹部隐痛2月余，多方治疗均罔效，翻阅病人处方，前医多从脾胃、肠道疾患治疗入手，陈氏仔细切诊病人腹部，诊见左侧少腹部有明显压痛，质稍硬，沿少腹部有条索状硬结，四诊合参，考虑为附件炎，遂以清热散结，祛瘀通络为法，很快治愈病人。
仅此一例，审查局部的重要性即可窥见一斑。
3．辨证论治，以辨病为核心：辨证论治是中医学的核心，是公认的中医学重要精华，它侧重于人的整体调整，重视调动机体内部的抵抗力和提高机体的适应性，达到“阴平阳秘”。辨病侧重局部器官的改变，辨病论治是采用针对性较强的药物直接作用于病灶，改善局部病损情况。
两者各有其长处，陈氏将侧重于整体与侧重于局部的两种论治方法融于一体，大大提高了治病疗效。
例如：肿瘤的治疗，目前西医常用化疗和放疗，虽然针对性很强，但对全身的毒性和副作用却无法解决，不少病人因此不能继续治疗。陈氏以辨病为核心的辨证论治，既注意针对局部肿瘤的抗癌解毒，又兼顾全身整体情况补益扶正，在常用抗癌药物白花蛇舌草、半枝莲等基础上，又筛选出针对性较强的核桃树枝、山慈姑，用于局部的抗肿瘤治疗；另外根据患者整体情况选用八珍、归脾、十全大补、参苓白术散等辨证论治。陈氏以此治疗一些鼻咽癌、直肠癌、乳腺癌等患者，有效地控制了临床症状，大部分患者可同时接受放疗、化疗且能够坚持，不少人都恢复了工作。
再如：治疗肾炎、肾病综合征，在辨证论治的基础上加用八月瓜、蛇倒退，功能利尿消肿，消除尿蛋白；治疗泌尿系感染疾患，如膀胱炎、尿道炎等，常适当加用红藤、忍冬藤，能快速控制症状。诸如配伍黄连治痢，麻黄平喘，青藤香止胃痛，白鸡冠花止带等，皆为陈氏结合辨病论治的常选药物。
陈氏这种以辨病为核心的辨证论治，其实质是将专药、辨病论治药物结合于辨证论治中，赋予辨证论治新的内容，使疗效稳定而显著。
