孙一奎（1522～1619年），宇义垣，号东宿，别号生十子。安徽休宁人。为汪石山再传弟子。
生平事迹
孙氏因父病而立志学医，先师以汪机的弟子黄古潭，又研究经典医著及诸大家典藉，诵读无间，历寒暑3年。又自新都（今四川新都县）游历鄱阳湖和庐山，沅、湘两水，苏南和浙江，到处访问名师。研究医术，历30年乃精于医，为人治病，每有良效，远近闻名。其子泰来、朋来。，门人余煌继其术，并将其医案编辑成《孙文垣医案》9卷行世孙氏治学，反对“徒以方书为捷径”而重视理论研究。他不仅沉酣《内》、《难》精究本草。参阅方书。并结合仲景以后历代各家医著，加以融会贯通。他认为“医者能因古人之法，而审其用法之时，斯得古人立法之心矣”，主张读古人书，必须深入研究其立言之意，进行全面分析。强调学医必须博采众长。其治学精神，值得今人借鉴孙氏主要著作有《赤水玄珠》30卷（1584年）、《医旨绪余》4卷、《痘疹心印》2卷，另有《孙文垣医案》9卷。由其子泰来、朋来、门人余煌编辑成书。
学术思想
孙氏的学术思想重在阐述命门、三焦等理论，其间亦颇有独到之见。
1论命门动气。孙氏命门学说。胎息于《难经》的有关论述。且受到《易经》哲学思想的影响。他认为人身的上极是两肾间的命门原气。即动气，并指出：原气为太极之体，动气为太极之用。两肾又是“太极之体所以立”的基础。实质上是指元气由元精所化，由于原气属阳，阳动则生；两肾属阴，阴静则化、从而生化成其他脏腑。故曰：，命门乃两肾中动气，…，乃造化之枢纽，阴阳之根蒂，即先天之太极，五行由此而生。脏腑以继而成。”命门犹如“坎”卦，一阳陷入二阴之中，是“坎中之阳”，是生命之本始。认为人之所以生存，乃“赖此动气为生生不息之根，有是动则生，无是动则呼吸绝而物化矣”强调呼吸根于肾间动气。他说：“呼吸者。即先天太极之功静，人之一身之原气也。”呼吸的原动力实为肾间动气，肺之能出气以呼，肾之能纳气而吸，无不由于原气之功，说明命门动气为生生不息之根，对于呼吸功能来说则特别重要。
2论三焦相火。三焦为六腑之一。有布散阳气，通调水道的生理功能。《难经》提出三焦“有名而无形”之说遂引起后世医家对三焦形质的论争。孙氏宗《难经》三焦无形之说，认为三焦是上、中、下三焦之地位的合称，“外有经而内无形”，因称“外腑”；三焦原非五行正腑，不同于其他五脏、五腑的合应，只得依附于膀胱，故又称“孤府”，他还认为“命门不得为相火，三焦不与命门配”，指出当以“三焦、包络为相火”为是，但命门却是“三焦之原”，三焦相火始于原气。出于上焦，为“原气之别使”，并引《难经本旨》之说以论三焦的作用：“所谓三焦者，于隔膜脂膏之内，五脏六腑之隙，水谷流行之关，其气融洽于其间，熏蒸膈膜，发达皮肤、分肉，运行四旁，曰上、中、下，各随部分所属而得名，虽无其实，合内外之实而为位者也。”说明三焦相火为原气之别使。有裨助生生不息之功”。
3论天人君相之火。孙氏指出，火“必先有定位而后可以言变化”。就天火言。六气之中，火居其二，君火少阴主二之气为热相火少阳主三之气为暑，暑热太过，人感为病，是为外火。就人火言，亦有君相之分，他认为人身君相之火均为人火、内火，不能以君相来分属天人，而心为君火，包络、：三焦为相火。乃是亘古不易之定论。“肝肾虽皆有火，乃五志之淫火。而非五行之正火”。肝肾火动，则为原气之贼。他把火分别内外、正邪，认为六气之火为天火、外火；七情所感为人火、内火。心包、三焦相火为正火，肝肾阴火为贼火，他还提出。由于医者不明天火的定位和节序，故往往不参考时令节气而滥用寒凉之剂，又不明人火的定位和伦序，妄以命门阳气为相火，而以滋阴降火之专剂，故促使虚损病人死亡，他认为这虽是医者之责，然而不明治火之原则是根本的原因。
4论临床施治之法。孙氏在治疗中“首重明正”，认为“凡证不拘大小轻重，俱有寒、热、虚、实、表、里、气、血”之分。且病变多有始同而终异，治法不能执一而无权变：在遣方用药中十分重视对三焦元气的保护与其三焦、命门理论相印证。认为不惟纯阴皆寒之剂可伤脾胃、耗元气，且“若用辛香散气燥热伤气，真气耗散”，又疏导过剂也可耗损元气，淡渗过剂，常致肾气夺伤。在三焦之中孙氏对下焦虚寒尤为重视，对气虚中满、肾泄等证，都认为是下焦虚寒所致，癃闭、遗尿、小便失禁亦与之有关；对下消肾不纳气等证则注意精气同治。此外，他对虚损治法。亦有精当之论、于噎膈、反胃二证及辨癫、狂、痫之异治，卓然有识。均值得参考：综上所述，孙氏提出命门为肾间动气，三焦为元气之别使。动气为生生不息之根相火有裨助生生不息之功，其论说不仅阐发了《难经》有关理论，且能自出机杼。并与临床实践相结合。对中医理论的发展亦作出了一定的贡献。
